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Remarques:

  • Les botanistes et les mycologues utilisent des conventions de dénomination systématiques pour taxons plus élevé que le genre en combinant la tige latine du genre type pour que taxon avec une caractéristique de fin standard du rang particulier. (Voir ci-dessous pour une liste des terminaisons standard.) Par exemple, la famille des rosacées Rosaceae est nommée d'après la tige "Ros-" du genre type Rosa plus la terminaison standard "-aceae" pour une famille.
  • Les zoologistes utilisent des conventions similaires pour taxons, mais seulement jusqu'au rang de superfamille.
  • Plus haute taxons et surtout intermédiaire taxons sont sujettes à révision à mesure que de nouvelles informations sur les relations sont découvertes. Par exemple, la classification traditionnelle des primates (classe Mammalia-sous-classe Theria-infraclass Eutheria-order Primates) est contestée par de nouvelles classifications telles que McKenna et Bell (classe Mammalia-subclass Theriformes- infraclass Holotheria-order Primates). Ces différences surviennent parce qu'il n'y a qu'un petit nombre de rangs disponibles et un grand nombre de points de branchement proposés dans les archives fossiles.
  • Au sein des espèces, d'autres unités peuvent être reconnues. Les animaux peuvent être classés en sous-espèces (par exemple, Homo sapiens sapiens, humains modernes). Les plantes peuvent être classées en sous-espèces (par exemple, Pisum sativum subsp. sativum, le pois potager) ou des variétés (par exemple, Pisum sativum var. macrocarpon, pois mange-tout), les plantes cultivées obtenant un nom de cultivar (par exemple, Pisum sativum var. macrocarpon "Snowbird"). Les bactéries peuvent être classées par souches (par exemple Escherichia coli O157: H7, une souche qui peut provoquer une intoxication alimentaire).

Suffixes de groupe

Taxons au-dessus du niveau du genre sont souvent donnés des noms dérivés de la racine latine (ou latinisée) du genre type, plus un suffixe standard. Les suffixes utilisés pour former ces noms dépendent du royaume, et parfois du phylum et de la classe, comme indiqué dans le tableau ci-dessous.

RangPlantesAlguesChampignonsAnimauxDivision / Phylum -phyta-mycotaSubdivision / Subphylum -phytina-mycotinaClasse-opsida-phyceae-mycetesSous-classe-idae-phycidae-mycetidaeSuperorder -anaeOrdre -alesSous-ordre -ineaeInfraorder -ariaSuperfamille -acea-oideaFamille -aceae-idaeSous-famille -oideae-inaeTribu -eae-iniSous-tribu -inae-ina

Remarques

  • La racine d'un mot peut ne pas être simple à déduire de la forme nominative telle qu'elle apparaît dans le nom du genre. Par exemple, le latin "homo" (humain) a la racine "homin-", donc Hominidae, pas "Homidae".
  • Pour les animaux, il existe des suffixes standard pour taxons jusqu'au rang de superfamille (article 27.2 de l'ICZN).

Développements historiques

La classification des organismes est une activité naturelle des humains et peut être la science la plus ancienne, car les humains ont besoin de classer les plantes comme comestibles ou toxiques, les serpents et autres animaux comme dangereux ou inoffensifs, etc.

Le premier système connu de classification des formes de vie provient du philosophe grec Aristote, qui a classé les animaux en fonction de leurs moyens de transport (air, terre ou eau), et ceux qui ont du sang rouge et qui ont des naissances vivantes et ceux qui n'en ont pas. . Aristote a divisé les plantes en arbres, arbustes et herbes (bien que ses écrits sur les plantes aient été perdus).

En 1172, Ibn Rushd (Averroes), qui était juge (Qadi) à Séville, a traduit et abrégé le livre d'Aristote de Anima (Sur l'âme) en arabe. Son commentaire original est maintenant perdu, mais sa traduction en latin par Michael Scot survit.

Un progrès important a été réalisé par le professeur suisse Conrad von Gesner (1516-1565). Le travail de Gesner était une compilation critique de la vie connue à l'époque.

L'exploration de parties du Nouveau Monde a ensuite apporté des descriptions et des spécimens de nombreuses nouvelles formes de vie animale. Dans la dernière partie du XVIe siècle et au début du XVIIe, une étude attentive des animaux a commencé, qui, dirigée d'abord vers des espèces familières, a été progressivement étendue jusqu'à ce qu'elle forme un ensemble de connaissances suffisantes pour servir de base anatomique pour la classification. Les progrès réalisés dans l'utilisation de ces connaissances pour classer les êtres vivants ont une dette envers la recherche d'anatomistes médicaux, tels que Hieronymus Fabricius (1537-1619), Petrus Severinus (1580-1656), William Harvey (1578-1657) et Edward Tyson (1649 - 1708). Les progrès de la classification grâce au travail des entomologistes et des premiers microscopistes sont dus aux recherches de personnes comme Marcello Malpighi (1628-1694), Jan Swammerdam (1637-1680) et Robert Hooke (1635-1702).

John Ray (1627 - 1705) était un naturaliste anglais qui a publié d'importants ouvrages sur les plantes, les animaux et la théologie naturelle. L'approche qu'il a adoptée pour la classification des plantes dans son Historia Plantarum était une étape importante vers la taxonomie moderne. Ray a rejeté le système de division dichotomique par lequel les espèces étaient classées selon un système préconçu, soit / ou type, et a plutôt classé les plantes selon les similitudes et les différences qui ont émergé de l'observation.

Linné

Deux ans après la mort de John Ray, Carolus Linnaeus (1707-1778) est né. Son grand travail, le Systema Naturae, a traversé douze éditions au cours de sa vie (1er éd. 1735). Dans ce travail, la nature a été divisée en trois domaines: minéral, végétal et animal. Linnaeus a utilisé quatre rangs: classe, ordre, genre et espèce. Il a consciemment fondé son système de nomenclature et de classification sur ce qu'il savait d'Aristote (Hull 1988).

Linné est surtout connu pour son introduction de la méthode encore utilisée pour formuler le nom scientifique de chaque espèce. Avant Linné, de longs noms à plusieurs mots avaient été utilisés, mais comme ces noms donnaient une description de l'espèce, ils n'étaient pas fixes. En utilisant systématiquement un nom latin à deux mots - le nom du genre suivi de l'épithète spécifique - Linnaeus a séparé la nomenclature de la taxonomie. Cette convention pour nommer les espèces est appelée nomenclature binomiale.

Classification après Linné

Certains développements majeurs dans le système de taxonomie depuis Linné ont été le développement de rangs différents pour les organismes et les codes de nomenclature (voir Systèmes de domaine et de royaume, et Codes universels ci-dessus), et l'inclusion de concepts darwiniens dans la taxonomie.

Selon Hull (1988), "à son apogée, la systématique biologique était la reine des sciences, rivalisant avec la physique". Lindroth (1983) l'a référé comme «le plus aimable des sciences». Mais à l'époque de Darwin, la taxonomie n'était pas tenue en si haute estime qu'elle l'était auparavant. Il a acquis une nouvelle importance avec la publication de Darwin L'origine des espèces, et notamment depuis la Synthèse Moderne. Depuis lors, bien qu'il y ait eu et continue d'avoir des débats dans la communauté scientifique sur l'utilité de la phylogénie dans la classification biologique, il est généralement admis par les taxonomistes aujourd'hui que la classification des organismes devrait refléter ou représenter la phylogénie, via le principe darwinien de commun descente.

Une orientation verticale donne un cladogramme qui rappelle un arbre.

La taxonomie reste une science dynamique, avec des tendances en développement, une diversité d'opinions et des doctrines opposées. Deux de ces groupes concurrents qui se sont formés dans les années 1950 et 1960 étaient les phénéticiens et les cladistes.

Commencé dans les années 1950, les phénéticiens ont privilégié l'analyse quantitative ou numérique et la reconnaissance de caractéristiques similaires parmi les organismes plutôt que de spéculer sur le processus et de faire des classifications basées sur la descendance évolutive ou la phylogénie.

La taxonomie cladistique ou le cladisme regroupe les organismes par des relations évolutives et organise taxons dans un arbre évolutif. La plupart des systèmes modernes de classification biologique sont basés sur une analyse cladistique. La cladistique est le plus important de plusieurs systèmes taxonomiques, qui incluent également des approches qui ont tendance à s'appuyer sur des personnages clés (comme l'approche traditionnelle de la systématique évolutive, comme le préconisent G. G. Simpson et E. Mayr). Willi Hennig (1913-1976) est largement considéré comme le fondateur de la cladistique.

Les références

  • Hull, D.L.1988. Science as a Process: An Evolutionary Account of the Social and Conceptional Development of Science. Chicago: University of Chicago Press.
  • Lindroth, S. 1983. Les deux faces de Linné. Dans Linné, l'homme et son œuvre (Ed. T. Frangsmyr) 1-62. Berkeley: University of California Press.

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